以2-氯甲基-3,4-二甲氧基吡啶盐酸盐与5-二氟甲氧基-2-巯基-1H-苯并咪唑为起始原料在氢氧化钠水溶液条件下缩合得到中间体5-二氟甲氧基-2-[[(3,4-二甲氧基-2-吡啶基)甲基]硫基]-1H-苯并咪唑,经过Sharpless不对称氧化得到粗品左旋泮托拉唑钠,再用丙酮重结晶,即可制得高纯度左旋泮托拉唑钠,总收率约65.5%,纯度99.90%。