转录组测序分析ZNF185在食管鳞状细胞癌中的作用机制

作者：宋乃成; 王磊; 张彬; 李寿康; 郑志坤^*; 李劲松^*

来源：华中科技大学学报(医学版), 2022, 51(03): 287-293.

DOI：10.3870/j.issn.1672-0741.2022.03.001

• 食管鳞状细胞癌
• ZNF185
• 转录组测序
• 信号通路

目的 通过转录组测序及生物信息学技术分析ZNF185在食管鳞状细胞癌(食管鳞癌)中的作用机制及其下游信号通路。方法 利用shRNA转染食管鳞癌细胞系Eca-109敲低ZNF185的表达，采用转录组测序技术检测mRNA的表达变化。根据测序数据筛选差异基因，通过GO功能分析和KEGG富集分析对差异基因相关的功能及信号通路进行分析。通过STRING工具分析差异蛋白的相互作用，构建出相关的蛋白互作网络，分析关键节点蛋白。结果 ZNF185干扰组与干扰对照组Eca-109细胞的差异基因共有3859个，其中表达升高的基因有2112个，表达下降的基因有1747个。显著富集的GO项目包括RNA剪接、细胞-基质连接、局部粘附等。KEGG富集分析表明ZNF185可能与HIF-1信号通路、p53信号通路有关，蛋白互作网络分析发现了BMP2、OAS2等关键蛋白。结论 通过转录组测序和生物信息分析筛选出ZNF185参与调控食管鳞癌可能的信号通路，为阐明食管鳞癌的发病机制提供了新的思路。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属协和医院