DNA序列碱基组合的频率矩阵及其应用

作者：李玉双; 刘倩; 张昱

来源：华侨大学学报(自然科学版), 2013, (03): 308-312.

• DNA
• 碱基组合
• 频率矩阵
• 相似性
• 编码序列 DNA
• nucleotide combination
• frequency matrix
• similarity
• coding sequence

基于碱基组合在DNA序列中出现的频率,构造11个物种的β-globin基因第一个外显子的编码序列的频率矩阵.借助矩阵2-范数对11个物种进行相似性比较,并结合柱状图对物种之间的相似性进行分析.研究结果表明:所构造的DNA序列频率矩阵不仅能够反映出DNA序列中碱基及碱基组合的含量分布,而且能够显示出序列碱基突变的情况.

• 单位
  燕山大学; 石家庄邮电职业技术学院