应用ABEEM方法计算含金属离子Ga3+蛋白的电荷分布

作者：卢丽男; 杨忠志

来源：辽宁师范大学学报(自然科学版), 2021, 44(01): 39-45.

• ABEEM方法
• 3+金属蛋白模型分子" name="keyword">Ga3+金属蛋白模型分子
• 3+金属蛋白大分子体系" name="keyword">Ga3+金属蛋白大分子体系
• 电荷分布
• 电荷转移

首次开发ABEEM方法应用于含金属离子Ga3+蛋白体系的研究.ABEEM方法将分子电荷分解到了原子区域、σ键区域、π键区域和孤对电子区域.对金属离子Ga3+与蛋白之间的相互作用采用成键模型,Ga3+与配体原子之间有键电荷分布.通过蛋白晶体数据库的搜索,总结出Ga3+离子和蛋白相互作用的模型分子,确定了相关的新的电荷参数.应用ABEEM方法对模型分子的电荷分布、电荷转移和Ga3+离子的电荷进行了计算和分析.结果表明,ABEEM方法计算的电荷可以和从头算的HF/STO-3G方法的结果相比拟,可以快速给出所有的模型分子的电荷分布.并且通过金属离子Ga3+蛋白大分子体系的电荷计算验证了ABEEM方法以及电荷参数的正确性和可转移性.高价态的Ga3+离子和蛋白的相互作用的理论研究,为其动力学模拟研究奠定了基础.

• 单位
  辽宁师范大学; 化学化工学院