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摘要
为了阐明肝细胞癌的分子机制,采用差异共表达的分析方法对TCGA数据库中HCC的转录组数据进行了生物信息学分析,识别出120 787对差异共表达对,其中1 526个基因被认为频繁参与差异共表达。与差异表达分析比较,识别的差异表达基因与差异共表达基因是相互补充的关系;差异共表达基因整合到人类调控网络识别出TP53、NFKB1和HIF1A等22个潜在调控差异共表达的转录因子。结合KEGG代谢途径识别出168个失调途径。相同代谢通路中基因间存在大量的差异共表达,如细胞周期代谢通路,在肝癌样品和癌旁样品中基因表达相关性发生显著改变的同时基因表达量也发生了显著变化。同时也识别出一些不能被GSEA识别的代谢通路,如JAK-STAT信号通路。本研究结果为进一步了解HCC分子致病机理,识别新型肝癌分子生物标志物提供依据。
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