具有胃癌遗传风险的环状RNA筛选及验证

作者：邹晨; 陶曙; 郎亚昆; 蒋孟林; 方娜; 范钰^*

来源：中华实验外科杂志, 2017, 34(04): 662-665.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1001-9030.2017.04.040

• 胃肿瘤
• 遗传
• 环状RNAs
• 芯片

目的筛选胃癌遗传风险环状RNA(circRNAs)进行筛选和验证。方法选择直系3代亲属患有胃癌的5对胃癌及其配对正常组织, 采用circRNAs芯片检测circRNAs表达水平, 筛选具有胃癌遗传风险的异常表达的circRNAs。为了验证芯片可靠性, 随机选取4个异常表达的circRNAs, 在36对胃癌及其配对正常组织采用荧光实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测。结果将胃癌组织中表达变化1.5倍以上者确定为差异表达者, 与正常胃组织比较, 其中44个circRNAs表达上调和56个circRNAs下调。随机选择2个下调的circRNAs(circRNA0004789和circRNA002373)和2个上调circRNAs(circRNA0004104和circRNA0005615), 采用RT-qPCR检测36对胃癌及其配对正常组织。结果显示, RT-qPCR检测与芯片检测结果无明显差异, 分别为circRNA0004789:t=1.134, P=0.374;circRNA0023736:t=2.308, P=0.147;circRNA0004104:t=0.795, P=0.510;circRNA0005615:t=3.157, P=0.087。结论 circRNAs在具有胃癌遗传风险的circRNA存在异常表达, 有可能作为胃癌遗传风险关键分子。

• 单位
  江苏大学附属人民医院; 江苏大学