基于共表达网络分析的Ⅰ期胃癌预后基因筛选

作者：礼想; 杨博文; 宫丽宝; 臧丹; 张朝旭; 张闯; 李智; 曲秀娟^*

来源：中国医科大学学报, 2021, 50(01): 1-8.

• 胃癌
• 脑酸可溶性蛋白1
• 加权基因共表达网络分析
• 转移

目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选Ⅰ期胃癌(SIGC)的预后因子并探讨其分子机制。方法通过WGCNA分析癌症基因组图谱(TCGA)中SIGC患者的临床数据,筛选影响SIGC预后的基因,并通过体外实验验证该基因对预后的影响。通过基因组富集分析(GSEA)进一步探索其影响胃癌预后的机制。结果 TCGA中共有胃癌数据330例,其中SIGC数据51例。脑酸可溶性蛋白1 (BASP1)基因高表达患者的总生存期(OS)明显短于低表达患者(P=0.016 25)。体外研究显示,抑制BASP1表达后,胃癌细胞迁移能力降低了62.2%。BASP1高表达富集了与肿瘤密切相关的IL6-JAK-STAT3通路(NOM p-val <0.001;FDR q-val <0.001)。结论 BASP1是SIGC的预后不良因子。BASP1可能通过调节IL6-JAK-STAT3通路促进胃癌细胞的迁移而导致胃癌预后不良。

• 单位
  中国医科大学附属第一医院