甜瓜Trihelix转录因子的鉴定与生物信息学分析

作者：郑玲; 李梦丹

来源：江苏农业科学, 2022, 50(16): 44-49.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.16.007

• 甜瓜
• Trihelix家族
• 生物信息学
• 表达模式

Trihelix转录因子在植物的光响应、生长发育以及逆境调节等生理活动中起着关键作用。对甜瓜Trihelix家族的基本信息、基因结构、进化关系、位置信息、表达模式和顺式作用元件等进行了分析。通过甜瓜基因组数据库共鉴定到26个Trihelix家族成员，且可被分为SIP1、GT-2、GT-1、SH4和GTγ5个亚家族。26个Trihelix基因不均匀地分布于12条染色体上，并在4号染色体上出现了基因簇。内含子的数量为0～17个不等。顺式作用元件分析中，鉴定到多种响应激素和环境信号的顺式作用元件。表达模式分析表明，SIP1亚族在甜瓜幼苗、根、茎、叶、花、果实的生长发育过程中发挥着重要作用。

• 单位
  洛阳师范学院; 生命科学学院