深圳地区艾滋病患者HIV-1毒株膜蛋白V3环的氨基酸变异分析

作者：王辉; 陆坚; 胡毅文; 李丽雄; 王火生; 周伯平

来源：中华传染病杂志, 2005, 23(5): 301-304.

DOI：10.3760/j.issn:1000-6680.2005.05.004

• HIV-1
• 病毒包膜蛋白质类
• 变异(遗传学)
• 亚型

目的了解深圳地区艾滋病患者体内不同HIV-1亚型膜蛋白V3环的氨基酸序列特征及变异特点.方法采用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nested-PCR)对艾滋病患者血浆HIV RNA进行扩增,对扩增产物直接测序并进行序列对比、翻译和分析.结果深圳地区艾滋病患者感染HIV病毒分属B与CRF01-AE亚型,病毒V3顶端的四肽特征主要为:GPGQ 48%、GPGR 36%、其他形式16%;其中AE亚型GPGQ百分比为76.9%,B亚型GPGR百分比为75%;还发现DQDR、DQGQ等少见V3环顶端四肽组成形式.V3环发生与SI表型有关的氨基酸突变形式高达80%.结论深圳地区艾滋病患者感染病毒V3环顶端四肽主要为GPGQ与GPGR,V3环序列高度变异,出现一些少见的V3环顶端四肽组成形式值得进一步研究.

• 单位
  深圳市东湖医院