基于Python的Crispr/Cas9 Oligos批量生成器

作者：彭景; 许杰; 程威; 尹重超; 陈恒玲^*

来源：绿色科技, 2021, 23(12): 172-226.

DOI：10.16663/j.cnki.lskj.2021.12.062

• Crispr/Cas9
• sgRNA
• oligos
• python
• tkinter

CRISPR/Cas9基因编辑技术可以对细胞特定的基因片段进行定点编辑,sgRNA作为CRISPR基因编辑技术的重要环节,cas9酶在其介导下可以对靶基因组进行相应切割,sgRNA有特定的规则来管理oligos的生成。基于此,创建了一个基于Python的Crispr/Cas9 oligos生成器的本地应用程序工具,允许用户批量地在输入sgRNA序列中设计正向和反向oligos。该软件是专门设计用于Crispr系统的基于sgRNA生成两条oligos的工具,相比较手动编写,提高了工作效率与精度。

• 单位
  生物医学工程学院; 中南民族大学