茎瘤固氮根瘤菌Azorhizobium caulinodans ORS571基因组分泌蛋白的生物信息学分析

作者：王新新; 吴亮; 朱生凤; 李广茹; 赵林; 吕妍; 李飞雪; 陈宇

来源：基因组学与应用生物学, 2012, (04): 394-400.

• 茎瘤固氮根瘤菌
• ORS571
• 基因组
• 分泌蛋白
• 核酸酶
• 抗氧化酶 Azorhizobium caulinodans
• ORS571
• Genome
• Secreted protein
• Nucleases
• Antioxidant enzymes

为了获取茎瘤固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans ORS571)的分泌蛋白,以便更深入地了解该菌的共生固氮作用,本研究采用SignalP、TMHMM、PSORTb、TargetP、LipoP、TatP和SecretomeP软件对该菌全部4717个蛋白序列进行分析预测。结果共识别了653个分泌蛋白,其中具有分泌型信号肽的蛋白54个,具有RR-motif型信号肽的蛋白1个,具有脂蛋白信号肽的蛋白2个和非经典分泌蛋白596个。该菌含信号肽分泌蛋白仅占全部蛋白的1.2%,低于其它固氮菌。在分泌蛋白中识别了核酸内切酶和核糖核酸酶等6个核酸酶。它们可能参与宿主植物遗传物质的降解,干...

• 单位
  天津大学; 中国海洋石油总公司