哺乳动物锌指蛋白家族中KRAB功能域的进化

作者：袁力赟; 赵中明; 丁国徽

来源：生物信息学, 2009, (03): 202-206+211.

• KRAB功能域
• 锌指基因
• 亚家族
• 进化 KRAB domain
• Zinc Finger Gene
• Subfamily
• Evolution

KRAB锌指基因是哺乳动物中最大的转录调控因子家族,它的多数成员在基因组上成簇分布,具有五种不同的亚家族,在功能行使上承担着不同的作用。本文通过对人类、黑猩猩、小鼠、大鼠和狗五种哺乳动物全蛋白质组序列及mRNA组织表达谱分析,验证了C2H2锌指结构在单个KRAB蛋白质中出现的数目多于一般锌指蛋白质;KRAB功能域在各物种中分布显著不同且与分化时间不成正比,这表明KRAB相关功能域多样性在灵长类进化过程中潜在的适应性进化。同时,提出KRAB亚家族进化的路线:即KRAB-Aa为起始家族,Ba由Aa直接演变形成,而Ca,blonga和XRCC三种亚型可能经过Ba或直接从Aa演变形成;此外,锌指结构在...

• 单位
  范德堡大学; 上海交通大学; 中国科学院