2019-2021年鸭坦布苏病毒广西流行毒株遗传多样性分析

作者：熊陈勇; 尹彦文; 施开创; 李军; 郑敏; 韦显凯; 冯淑萍; 龙凤; 屈素洁; 陆文俊; 周洪槿; 黄海莲; 谢守玉^*; 黎宗强^*

来源：中国畜牧兽医, 2022, 49(08): 3099-3111.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2022.08.026

• 鸭坦布苏病毒(DTMUV)
• 开放阅读框(ORF)
• E基因
• NS5基因
• 遗传多样性

【目的】研究鸭坦布苏病毒(Duck Tembusu virus, DTMUV)广西毒株分子遗传特征，以期了解、掌握DTMUV广西毒株流行新特点，为及时调整、制定有效防控措施提供数据支持。【方法】采集2019-2021年广西各地的鸭组织病料，采用已建立的实时荧光定量RT-PCR方法检测DTMUV,根据毒株检测年限和来源地选取部分阳性样品进行DTMUV全序列扩增及测序，并进行序列相似性、重要蛋白关键氨基酸位点、系统发育、全序列重组及遗传进化速率分析。【结果】共获得8株DTMUV全序列，基因组全长为10 992 bp,为广西毒株。广西毒株之间开放阅读框(ORF)及E、NS5基因的核苷酸序列相似性分别为97.9%～99.8%、97.0%～99.9%和97.8%～99.9%,氨基酸序列相似性分别为99.1%～99.9%、99.0%～100%和99.3%～99.9%;与国内外参考毒株的核苷酸序列相似性分别为86.4%～99.3%、85.8%～99.5%和87.1%～99.2%,氨基酸序列相似性分别为96.0%～99.8%、94.8%～100%和97.5%～99.9%,且与水禽源TMUV相似性高于其他宿主源。与疫苗株FX2010相比，DTMUV广西毒株E蛋白共有11个氨基酸位点发生变异，其中第43、150、153、326、403、464及487位为广西毒株独特的氨基酸突变。ORF遗传进化分析结果显示，广西毒株均分布于2.1亚群，而源自广西的GX2011和GX2015株隶属于2.2亚群，表明DTMUV广西流行毒株进化趋势不完全一致；E、NS5基因系统发育趋势与ORF相似。重组分析结果表明，GXBH01-2019、GXZS02-2020、ziYY150901及HB2016株检测有重组信号。E、NS5基因的遗传进化速率估算分别为1.31×10-3和1.30×10-3替换/(位点·年),表明二者进化较为同步。【结论】当前DTMUV广西流行毒株表现为与主要流行毒株亲缘性较近，E蛋白发生特有氨基酸突变，进化趋势不一致，存在重组现象等分子特征，结果为制定有效防控措施提供了基础数据。

• 单位
  广西大学; 广西壮族自治区动物疫病预防控制中心