基于加权基因共表达网络分析高血压的关键基因

作者：彭晖; 徐长福; 沈盛晖; 童鸿^*

来源：心脑血管病防治, 2021, 21(03): 254-257.

• 高血压
• 加权基因共表达网络
• 关键基因

目的挖掘分析高血压的关键基因,为阐明高血压的发病机制提供生物信息学支持。方法从GEO数据库下载GSE 74 144数据进行差异表达基因(DEG)分析,并使用WGCNA包筛选高血压临床特征相关的模块和基因,而后用ClusterProfiler进行基因功能的注释富集分析。将DEG与WGCNA中的性状模块基因取交集,获取关键基因,并对其进行相关性分析。结果共筛选出79个DEGs,主要与氧化磷酸化、线粒体内膜蛋白复合物形成和呼吸小体形成等有关。获得1个与高血压高度相关的模块,主要参与血小板活化、局部粘附、RAP1信号通路等,并获取12个关键基因FAM69B、FLJ44511、EPB49、CDKN2A、ND2、OST4、HIST1H2BI、ODF3L2、SPARC、MMD、TMEM140和DDX11L2。结论通过WGCNA获得与高血压高度相关的模块和12个关键基因,为更深入地探索高血压发生发展机制提供理论依据。

• 单位
  浙江省立同德医院