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摘要
目的建立高通量、半自动化细菌全基因组序列测定体系,满足基于基因组序列的细菌性病原体监测的需求。方法使用自动化液体处理器、可丢弃性机械手枪头、96孔板型核酸提取试剂盒、自动测序文库构建系统以及测序仪,实现细菌基因组序列测定的半自动化。结果机械手枪头与加样孔底的距离、液体混合速度和每次混匀液体的体积比3个因素与样品之间的交叉污染密切相关,机械手枪头与加样孔底的距离为2 mm、液体混合速度为全速的15%、每次混匀液体的体积比为50%时污染率为0。与手工方法相比,高通量半自动化细菌全基因组序列测定体系的工作效率提高了4倍。结论建立的高通量、半自动化细菌基因组序列测定体系,能够满足基于基因组序列的细菌性病原体监测的需求。
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单位中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 河北北方学院
