基于网络药理学联合GEO数据分析探讨银杏叶治疗糖尿病肾病的作用机制

作者：庞欣欣; 彭紫凝; 邢玉凤; 石秀杰; 张雅歌; 韩佳瑞^*

来源：中国医药生物技术, 2020, 15(06): 584-593.

• 银杏叶
• 糖尿病肾病
• 网络药理学
• GEO数据
• 作用机制

目的通过网络药理学研究方法,联合GEO数据库分析验证,探讨中药银杏叶治疗糖尿病肾病的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选银杏叶的有效成分和靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、GAD等数据库查找与糖尿病肾病相关的靶点。利用Cytoscape软件分析银杏叶治疗糖尿病肾病的作用靶点与有效成分之间关系网络。分析GEO数据库芯片,验证关键靶点。通过DAVID数据库分析银杏叶治疗糖尿病肾病的有效靶点的生物学功能和作用机制。结果根据口服利用度和药物相似性原则筛选出银杏叶有效成分27个,筛选出的有效成分作用靶点201个。在GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、GAD等数据库中筛选出有关糖尿病肾病靶点10 859个。通过Cytoscape软件筛选,得到银杏叶治疗糖尿病肾病的关系网络共621条。GEO芯片分析验证,前5个关键靶基因VEGFA和CASP3具有差异显著性。采用DAVID数据库进行GO和KEGG分析,得到晚期糖基化终末产物及受体、流体剪切应力与动脉粥样硬化、炎症、细胞凋亡等关键信号通路。结论该研究初步揭示,银杏叶通过多靶点、多通路治疗糖尿病肾病,其有效作用靶点主要通过蛋白激酶、炎症因子、血管内皮生长因子等作用于多条信号通路,其中AGEs-RAGE信号通路是其发挥治疗作用的重要通路。银杏叶可能直接或间接参与调节氧化应激、炎症、细胞凋亡等作用机制治疗糖尿病肾病,为今后分子生物学实验奠定了基础。

• 单位
  河南省中医院; 第二临床医学院; 河南中医药大学