河八王杂交种F_1、BC_1及其亲本DNA甲基化水平和模式变化

作者：刘昔辉; 桂意云; 张荣华; 李海碧; 韦金菊; 周会; 杨荣仲; 张小秋; 李杨瑞

来源：中国农业大学学报, 2019, 24(09): 37-46.

• 甘蔗
• 河八王
• DNA甲基化
• 甲基化敏感扩增多态性技术
• 毛细管电泳技术

为分析河八王及后代基因组DNA甲基化水平和遗传模式变化,以河八王及其后代F1和BC1为材料,采用甲基化敏感扩增多态性技术（Methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP）结合毛细管电泳技术（Capillary electrophoresis,CE）分析亲本及后代基因组DNA甲基化水平和遗传模式变化规律。结果表明:母本‘GT05-3256’的MSAP比率是59.6%,父本‘GXN1’则是60.5%,其杂交种F1的MSAP比率是56.4%～59.0%,均低于双亲;BC1的母本‘YC94-46’的MSAP比率是59.4%,父本‘T6-3’则是59.0%,BC1MSAP比率是56.9%～69.8%,整体平均为62.8%,平均值高于双亲。BC1世代总甲基化水平略高于F1世代水平。F1和BC1基因组CCGG位点发生甲基化的方式整体上以内部胞嘧啶双链甲基化为主。在F1和BC1中均检测到70种甲基化类型,并进一步分为A、B、C、D和E等5大类,其中A类是亲本向杂交种的甲基化遗传类型;B类是去甲基化类型,表示杂交种相应于其亲本的甲基化减弱;C类是过或超甲基化类型,表示杂交种相应于其亲本的甲基化增强;D类是次甲基化类型,杂交后代甲基化水平比双亲均要低;E类为不定类型。结果显示,B、C、D、E是杂交种的甲基化变异类型;F1的甲基化遗传类型（A类）比例明显低于BC1,但变异类型B、C、D、E高于BC1;杂交形成F1和BC1过程中,基因组DNA普遍发生了超甲基化修饰。

• 单位
  广西大学; 中国农业科学院; 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所