寒旱区柠条根际细菌群落结构与多样性研究

作者：张春林; 尚晓蕊; 赵鑫; 孙震; 王瑞刚; 李龙梅^*

来源：北方园艺, 2021, (17): 97-103.

• 柠条
• 根际细菌
• 多样性
• 二代高通量测序

以柠条为试材,采用Illumina MiSeq二代高通量测序技术对16S rDNA基因进行测序,研究了不同地区和同一地区不同取样点的柠条根际土壤细菌微生物群落结构及多样性,以期为认识和利用柠条根际细菌微生物及对柠条抗寒抗旱性的深入研究提供参考依据。结果表明:同地区不同取样点的9个样品共检测出11个相对丰度较高的类群,相对丰度高的共有优势门是Actinobacteria(22.40%～36.41%)、Proteobacteria (18.46%～35.61%)、Acidobacteria(6.67%～25.73%)、Chloroflexi(5.04%～15.26%)和Bacteroidetes(2.85%～6.83%)。在属水平,未知属norankc_Subgroup6是其共有优势属,每个样品中物种分布广泛但相对丰度较低。巴彦淖尔盟地区主要类群为Sphingomonas、Arthrobacter、Streptomyces、Nocardioides、Mycobacterium和Aeromicrobium。赤峰3个样品的细菌组成具有较大差异,主要的类群为Arthrobacter、Bacillus、Streptomyces和Sphingomonas。乌兰察布3个样品的物种组成也具有一定差异,主要类群为Arthrobacter、Bacillus和Streptomyces。柠条根际土壤细菌种类繁多,同一地区不同取样点细菌群落结构和多样性相近,不同地区间赤峰和乌兰察布样品的细菌微生物丰富性高于巴彦淖尔盟样品。

• 单位
  内蒙古农业大学