基于线粒体COI基因的中华鳖3个品系遗传多样性分析

作者:梁宏伟; 曹力欢; 罗相忠; 朱成骏; 崔峰*; 邹桂伟*
来源:基因组学与应用生物学, 2021, Z3: 2908-2915.
DOI:10.13417/j.gab.040.002908

摘要

中华鳖(Pelodiscus sinensis)是我国重要的养殖渔业生物。近年来,因其自然野生种群数量不断减少,地方优良种质资源日益受到重视。为了深入了解目前重要养殖中华鳖品系的遗传本底现状,以期为中华鳖的保护及地方优良种质资源的挖掘利用提供依据,本研究以中华鳖淮河品系、黄河品系和日本品系为研究对象,通过对93个个体的COI基因序列进行分析,结果发现其序列共有57个核苷酸变异位点,其中单位点碱基突变11个,简约信息位点46个。所有序列可定义为21种单倍型,单倍型多样性为0.858,核苷酸多样性为0.004,表明当前中华鳖的遗传多样性比较丰富。在3个品系中,日本鳖遗传多样性最高,淮河鳖次之,黄河鳖最低。群体间的遗传分化指数为0.468 9~0.648 1,基因流为0.135 7~0.283,说明3个品系间存在较大的遗传分化。建议在今后的保护和利用中,应注重中华鳖的遗传多样性保持,合理选种选配,加强良种利用,以促进优质高效中华鳖产业的高质量发展。