基于生物信息学分析结直肠癌STIM1高频突变介导的免疫抵抗模式及其分子机制

作者：袁浩; 钟华戈; 严林海; 唐卫中^*

来源：中国癌症防治杂志, 2020, 12(05): 566-571.

• 结直肠癌
• 免疫抵抗
• STIM1
• RELA
• JUN
• 分子机制

目的探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)基因突变频谱及其介导的CRC免疫抵抗的分子机制。方法选择2019年1月至2020年1月广西医科大学附属肿瘤医院收治的CRC患者36例,采用新一代测序(NGS)技术检测组织和血液样本中的基因突变情况。对突变频谱进行分子网络事件描述,采用TIMER和CancerSEA数据库对核心分子进行免疫浸润和组织单细胞分布分析,用Reactome数据库对核心分子进行功能聚类分析,利用STRING数据库分析核心免疫抵抗事件网络。结果组织和血液样本检测结果显示,基质相互作用分子1(stromal interaction molecule 1,STIM1)为筛选的高频突变基因(突变频率为97.2%)。免疫浸润和单细胞分布显示STIM1与RELA、JUN共同参与免疫反应,STIM1、RELA与JUN m RNA在结肠癌患者中的表达与CD4+T细胞的浸润水平显著相关(r=0.554,0.565,0.319,均P<0.05),且RELA、JUN均与STIM1呈正相关(r=0.579,0.223,均P<0.05)。Kaplan-Meier分析结果显示,CD4+T细胞和巨噬细胞浸润水平越高,结肠癌患者生存预后越差。功能聚类分析显示,STIM1与适应性免疫系统、固有免疫系统、免疫系统中的细胞因子信号转导以及免疫反应蛋白类泛素化修饰相关,PPI网络分析显示,STIM1与RELA、JUN相关。结论 STIM1可能与RELA、JUN共同参与免疫抵抗网络形成,是CRC免疫抵抗中的重要调控因素及潜在的治疗靶点。

• 单位
  广西医科大学附属肿瘤医院