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摘要
目的:研究早发型子痫前期（EOPET）胎盘组织中mi RNA的表达差异,并应用生物信息学方法分析筛选关键的mi RNA和靶基因,探索早发型子痫前期发病的分子机制。方法:从公共基因芯片数据库（GEO）搜索有关早发型子痫前期mi RNA、m RNA表达的数据（GSE103542、GSE74341）,利用R软件分别筛选早发型与晚发型子痫前期、正常对照的胎盘组织中表达差异的mi RNA和m RNA,采用mi RWalk软件对7种差异性表达mi RNA的相关靶基因进行预测,并与筛选出的差异m RNA取交集即为得到的靶基因,将靶基因通过cytoscape,DAVID软件进行网络分析寻找核心分子。结果:共筛选出6个早发型子痫前期相关的mi RNAs和86个相关的靶基因,这些靶基因主要与c GMP-PKG信号通路、类风湿性关节炎通路、局部粘附、HIF-1信号通路有关,蛋白质网络互作预测得到了4个重要的EOPET相关蛋白质靶标,分别为COL5A1、COL6A1、DCN、ENG等基因。结论:通过对GEO数据集进行数据挖掘,共挖掘出6个早发型子痫前期相关的mi RNAs,在其作用的靶基因中挖掘出4个关键的靶基因,今后对其进一步研究,将有助于阐释EOPET的分子机制,开发新型生物标志物和治疗靶点。
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