科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
通过对同一实验条件下黄河鲤(Cyprinus carpio)群体中体重极大和极小的样本进行转录组测序，挖掘生长相关的基因和信号通路。基于转录组数据进行差异表达基因分析，在脑、肝和肌肉组织中分别筛选出差异表达基因6 519个、499个和19个。其中，脑组织中上调基因3 443个，下调基因2 942个；肝组织中上调基因275个，下调基因186个；肌肉组织中上调基因6个，下调基因5个。对差异表达基因进行了功能注释和通路富集分析，定位到MAPK信号通路、胰岛素(insulin)信号转导通路、Wnt信号通路、ErbB信号通路、肌动蛋白细胞骨架调节等与细胞生长、分化、代谢相关的信号通路。为了验证转录组结果的可靠性，本研究通过荧光定量PCR验证了黄河鲤脑组织中与生长密切相关的13个差异表达基因，其中mapk1、mapk7、mapk10、mapk12、wnt16、wnt8b、wnt10b显著上调(P<0.05),fgf13、ednra、notch2、tgfbr2、fgf19、lpl显著下调(P<0.05)。本研究通过组学数据分析和实验验证筛选了生长相关的基因，为深入挖掘黄河鲤生长性状调控机制和分子标记辅助育种提供了研究依据。[中国渔业质量与标准，2022,12(2):22-31]
-
单位上海海洋大学; 中国水产科学研究院; 河南省水产科学研究院
