自建MALDI-TOF MS霉菌数据库的研究

作者：李艳君; 孙钊坤; 丁赔赔; 王姣贤; 董蓉; 赵强元^*

来源：国际检验医学杂志, 2021, 42(06): 645-652.

• 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
• 霉菌
• 数据库

目的建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)霉菌数据库,提高引起临床相关感染的各种霉菌的鉴定能力。方法收集临床标本来源的霉菌266株,纯培养后进行霉菌18SrDNA扩增测序,获得菌种鉴定结果。选取210株霉菌用于数据库的构建,通过甲酸萃取法提取蛋白,应用MALDI-TOF MS配套的FlexControl软件收集蛋白谱图,采用Biotyper软件构建评价数据库。其余56株霉菌用于数据库鉴定能力的验证,分别用商品化数据库、自建的MALDI-TOF MS数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,应用χ2检验比较数据库的鉴定率差异。结果自建本地化MALDI-TOF MS霉菌鉴定数据库包含19个菌属,67个菌种,共计204株霉菌的质谱图。用于数据库验证的56株霉菌中,用商品化数据库鉴定正确18株,鉴定正确率为32.1%,用扩展数据库鉴定正确51株,鉴定正确率为91.1%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论自建霉菌数据库提高了霉菌的鉴定能力,从而有助于临床霉菌感染的病原诊断和治疗。

• 单位
  解放军总医院