猪BMPR1B基因的生物信息学分析

作者：王君岩; 张涵; 刘哲熹; 白珂瑞; 王德鹏; 吴克亮^*

来源：江苏农业科学, 2023, 51(01): 32-44.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2023.01.005

• 猪
• BMPR1B基因
• 生物信息学
• 选择压力
• 分子共进化

为了分析猪骨形态发生蛋白1B型受体BMPR1B蛋白的理化性质、高级结构、结构域、亚细胞定位、N-糖基化、同源进化关系、选择压力以及分子内共进化等，利用生物信息学软件及平台，对BMPR1B基因的结构与功能进行鉴定，为进一步探讨BMPR1B基因在母猪繁殖性状中发挥的作用奠定遗传信息基础。结果表明，猪BMPR1B基因编码502个氨基酸；相对分子量为56 960.47,理论等电点为7.78,带正电，呈碱性，不稳定，是一种跨膜的亲水蛋白；二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主，三级结构由1条主链和1条侧链构成，模型稳定，构象合理；具有3个保守的功能结构域，为激活素受体结构域、GS结构域和丝氨酸/苏氨酸激酶结构域；定位于细胞膜上，无信号肽序列，为非GPI锚定蛋白；另含有13个潜在的N-糖基化位点。系统进化分析表明：物种间，猪BMPR1B基因与马的同源性最高；物种内，猪BMPR1B基因类型上可以分为3个组，值得注意的是梅山猪作为独立的一支被分为一组，与猪的高繁殖力性状有一定联系。选择压力分析显示：猪BMPR1B基因经历了强烈的净化选择，十分保守，但在M7vs.M8模型中发现了44个强烈的正选择位点。分子共进化显示，在猪BMPR1B基因中检测到4组协同进化，涉及10个氨基酸。

• 单位
  中国农业大学