牛病毒性腹泻病毒CC13B株全基因组序列及分析

作者：朱利塞; 邢泽黎; 贾川川; 王婷; 盖小春; 宋林泽; 王曦岩; 涂长春; 王新平

来源：中国兽医学报, 2014, 34(07): 1065-1071.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2014.07.006

• 牛病毒性腹泻
• 黏膜病
• 牛病毒性腹泻-黏膜病
• 牛病毒性腹泻病毒
• 基因型
• BVDV
• CC13B

从长春地区某牛场发生疑似为牛病毒性腹泻-黏膜病的病牛粪样中分离到1株病毒,经序列测定为牛病毒性腹泻病毒命名为BVDV CC13B株。核苷酸序列的测定结果显示,CC13B毒株的完全基因组序列由12 265个核苷酸组成,其中5′端非编码区包含380个核苷酸,3′端非编码区包含188个核苷酸。病毒基因组含有1个大的读码框架,编码1个由3 898个氨基酸组成的前体多聚蛋白。序列对比结果显示,CC13B毒株的核苷酸和氨基酸序列与国外CP-5A毒株同源性最高,分别为为96.2%和97.3%;而与国内分离株JZ05-1的同源性最低,分别为69.8%和71.0%。系统进化树分析结果表明,CC13B毒株与国内分离的长春184、Xinjiang-3156和H等分离株归类为BVDV基因Ⅰ型的Ib基因亚型。结果表明,长春地区近年发生的牛病毒性腹泻-黏膜病依然主要由BVDV基因Ⅰ型毒株引起。

• 单位
  军事医学科学院军事兽医研究所; 吉林大学