巨菌草(Cenchrus fungigraminus)全基因组CAMTA家族转录因子的鉴定及进化分析

作者：姜晓梦; 袁振; 朱方捷; 周晶; 毛飞^*; 林冬梅; 林占熺

来源：福建农林大学学报（自然科学版）, 2023, 52(01): 10-16.

DOI：10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2023.01.002

• 巨菌草
• CAMTA转录因子
• 全基因组鉴定
• 进化分析
• 干旱胁迫

采用生物信息学方法鉴定了巨菌草(Cenchrus fungigraminus Z. X. Lin&D.M. Lin&S. R. Lan sp. nov.)中CAMTA(calmodulin-binding transcription activator)转录因子的家族成员，并对其蛋白序列的理化性质、基因结构、保守基序、保守功能结构域、系统进化发育关系、启动子区域顺式作用元件进行了分析；探讨了巨菌草CAMTA((CfuCAMTA))家族成员在干旱胁迫下转录水平的变化，以及CfuCAMTA转录因子对响应干旱胁迫的影响.结果表明：巨菌草CAMTA家族共有15个成员，其中仅CfuCAMTA10和CfuCAMTA11较为稳定，不稳定系数小于40;多数成员为不稳定蛋白质；巨菌草和紫象草CAMTA基因的亲缘关系最近；4个CAMTA转录因子的表达水平随干旱时间的延长，在第14天表达量达到最大，说明这些CAMTA参与了干旱胁迫的响应.

• 单位
  国家菌草工程技术研究中心; 福建农林大学; 生命科学学院