摘要

探索GhCKX6基因结构与功能。利用PCR技术,克隆GhCKX6基因,并应用生物信息分析软件对该基因的保守序列、蛋白理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、三级结构、磷酸化位点进行预测和分析。陆地棉GhCKX6基因的ORF核苷酸长度1554 bp,编码517个氨基酸;GhCKX6无跨膜区,无信号肽,为疏水性蛋白;其二级结构主要为α-螺旋和无规则卷曲,对于三级结构预测结果可信。并且其蛋白共有40个磷酸化位点,丝氨酸的磷酸化位点最多;系统发育树分析表明,GhCKX6与木槿的蛋白亲缘关系最近。首次在陆地棉中成功克隆得到GhCKX6基因CDS序列,并解析了该基因编码氨基酸序列的生物信息学特征,为深入了解陆地棉GhCKX6基因的功能奠定基础。