基于线粒体COⅠ的南海北部长棘银鲈遗传多样性分析

作者：裴丽梅; 宫亚运; 黄柏炎^*; 章群^*; 徐示; 王业磷

来源：海洋渔业, 2020, 42(03): 257-265.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2020.03.001

• 长棘银鲈
• COⅠ
• 遗传多样性
• 南海北部

为了解中国长棘银鲈(Gerres filamentosus)的遗传背景以更好地保护与开发利用种质资源,测定了南海北部7个群体线粒体COⅠ基因5′端序列,以分析其遗传多样性和遗传结构。结果发现,176尾长棘银鲈652 bp序列中有25个单倍型,155个变异位点。7个群体整体呈现较高的单倍型多样性(Hd=0.767±0.018)与较低的核苷酸多样性(π=0.055 0±0.003 7)。就遗传多样性指数而言,碣石群体(Hd=0.606±0.092,π=0.059 2±0.006 6)最高,次高为阳江群体(Hd=0.323±0.102,π=0.027 0±0.010 7);琼海群体(Hd=0.560±0.125,π=0.001 0±0.000 3)最低,次低为陵水群体(Hd=0.685±0.077,π=0.001 5±0.000 3)。群体遗传分化系数Fst显示,碣石、阳江群体与其他群体间存在高度(极显著)的遗传分化(Fst=0.517 1～0.851 4,P<0.001),这2个群体间有低等程度(显著)的遗传分化(Fst=0.111 1<0.15,P<0.05),而其他群体间无明显分化(Fst=-0.025 5～0.008 8,P>0.05)。AMOVA分析显示,群体变异主要来源于群体内个体间(61.69%～74.13%),但群组间仍有较多变异(19.06%～37.92%);原因可能与历史上琼州海峡的阻碍、当代复杂的海流以及长棘银鲈只进行短距离洄游等生态特性有关。中性检验显示,海南陵水、东方和新盈群体在晚更新世时期发生过种群扩张,但南海长棘银鲈总体未呈现种群扩张现象,可能是不同谱系的叠加造成整体核苷酸不配对分析图呈现多峰。碣石和阳江群体与其他群体间有高度的遗传分化,可将它们作为一个独立的管理保护单位,其中碣石群体遗传多样性最高,应重点保护;其他群体可作为另一管理保护单位,其中琼海和陵水群体遗传多样性较低,建议及时采取保护措施,避免遗传多样性过度下降而导致资源枯竭。

• 单位
  暨南大学