人巨细胞病毒gH和PP65蛋白的B、T细胞优势抗原表位预测

作者：张倩文; 王爽; 祝颖; 刘泽媛; 余波; 王斌^*

来源：精准医学杂志, 2021, 36(02): 170-175.

DOI：10.13362/j.jpmed.202102017

• 巨细胞病毒
• gH蛋白
• PP65蛋白
• 表位作图
• 表位,B淋巴细胞
• 表位,T淋巴细胞
• 病毒疫苗
• 计算生物学

目的利用生物信息学方法分析预测人巨细胞病毒(HCMV)膜表面糖蛋白gH以及磷酸化蛋白65(PP65)的B细胞、T细胞优势抗原表位,为HCMV亚单位疫苗的研发提供理论依据。方法从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中获取HCMV的gH和PP65蛋白的氨基酸序列。通过ABCpred、BCPred和BepiPred软件预测gH和PP65蛋白的B细胞优势抗原表位;利用NetMHCⅡ2.3 Server和NetMHCⅡpan 4.0 Server软件预测gH和PP65蛋白的CD4+T细胞优势抗原表位;使用NetMHC 4.0 Server和IEDB软件预测gH和PP65蛋白的CD8+T细胞优势抗原表位;最后由VaxiJen v.2.0 Server软件对上述得到的所有抗原表位进行抗原性分析。结果gH和PP65蛋白的二级结构中无规卷曲均占比最高,分别为40.51%、52.94%;综合所有软件的预测结果并进行抗原性分析后,获得gH蛋白CD8+T细胞优势抗原表位20个,CD4+T细胞优势抗原表位15个,B细胞优势抗原表位1个,获得PP65蛋白CD8+T细胞优势抗原表位8个,CD4+T细胞优势抗原表位8个,B细胞优势抗原表位3个。结论 HCMV的gH和PP65蛋白均含有丰富的B、T细胞优势抗原表位,可为HCMV亚单位疫苗的抗原肽选择提供理论依据。

• 单位
  青岛大学; 基础医学院