新疆五家渠鱼类水霉病原菌18S rDNA序列不同软件系统分析

作者：魏冬梅; 申慧; 陈真; 王咏星^*

来源：基因组学与应用生物学, 2019, 38(11): 4944-4950.

DOI：10.13417/j.gab.038.004944

• 水霉病
• 系统发育树
• 分类
• 18S rDNA

本研究在对新疆五家渠地区15株鱼类水霉病病原菌18S rDNA克隆测序的基础上,探讨了18S rDNA序列中G-C含量用于真菌分类的可行性,以及不同进化分析软件分析的可靠性。显示18S rDNA GC含量用于辅助分类具有一定可行性;不同软件构建的系统进化树拓扑结构基本一致,即不同软件应用于分类基本趋同;综合各软件分类,15株病原菌中LF04、LF01、JX03、JX01为寄生水霉,HL04、JY07、HZ、JY10、LY04、JY15、HL01为镰刀菌,JX02为腐霉,HL02为虫草科未知种,JY06与HZ02不能确定其种属。本研究为国内水霉分类研究以及鱼类水霉病的病原鉴定和后期药物防治提供一些数据。