基于GC-MS与生物信息学探讨矮地茶中挥发油治疗慢性阻塞性肺疾病的主要活性成分及作用机制

作者：刘国伦; 赵迪; 冯素香^*

来源：中国现代应用药学, 2023, 40(01): 38-46.

DOI：10.13748/j.cnki.issn1007-7693.2023.01.005

• 矮地茶
• 挥发油
• 气相色谱-质谱联用
• 网络药理学
• 分子对接

目的 基于GC-MS技术和系统生物学方法预测矮地茶挥发性成分治疗慢性阻塞性肺疾病(chronicobstructive pulmonary disease,COPD)的作用机制。方法 采用GC-MS分析矮地茶挥发油成分并通过面积归一化法确定各成分的相对含量，利用TCMID、TCMSP、PharmMapper数据库筛选矮地茶挥发油主要活性成分与靶点，运用Cytoscape软件构建矮地茶“成分-靶点”网络，OMIM、Genecards数据库挖掘COPD相关靶点，利用String数据库和Cytoscape软件构建并绘制蛋白互作网络；通过Metascape数据库进行通路富集分析；进一步借助DiscoveryStudio(Version4.5)软件评估化合物与核心靶点的亲和能力。结果 筛选出5个主要共有活性成分，潜在靶点154个，核心靶点包括NTRK1、TNF、VEGFA、MAPK1和M2C2。通过GO富集分析得到2 665个条目(P<0.05)，其中包括生物过程2 220条，分子功能233条，细胞组分212条。KEGG通路为242条(P<0.05)，主要涉及血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor,VEGF)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、NF-κB信号通路。分子对接结果显示石竹烯、蛇麻烯、依兰烯与核心靶点有较高的结合能力。结论 矮地茶挥发油可能通过TNF、VEGFA、MAPK1等靶点调节VEGF、TNF、NF-κB等通路治疗COPD。

• 单位
  河南中医药大学