基于GEO数据库分析AKR1C3在口腔鳞状细胞癌中的表达

作者：李磊; 陈彦平^*; 杨凯成; 李悠; 王欣晨; 罗风玉

来源：口腔医学研究, 2021, 37(06): 514-518.

DOI：10.13701/j.cnki.kqyxyj.2021.06.008

• 口腔鳞状细胞癌
• 基因表达数据库
• 分子标志物
• 差异表达基因

目的:探讨AKR1C3在口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)中的表达水平及其功能。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中筛选OSCC相关芯片数据集,利用R语言筛选出芯片中的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),对DEGs进行功能富集分析,构建蛋白质相互作用网络图(protein-protein interaction network, PPI)及DEGs相关性图,分析DEGs AKR1C3的表达水平与预后的关系,并通过免疫组织化学法验证AKR1C3蛋白在OSCC中的表达。结果:共筛选出411个DEGs,其中显著上、下调的DEGs分别有20个;DEGs主要参与T细胞活化、淋巴细胞活化等过程,并富集于细胞因子间的相互作用、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路;PPI显示:AKR1C3与AKR1C1、AKR1B10、AKR1B1等关系最为密切,DEGs相关性分析显示:AKR1C3与ALDH3A1、UGT1Ab等关系最为密切;AKR1C3高表达的患者生存期更短(P<0.05);免疫组织化学法结果提示:AKR1C3蛋白在OSCC组织中表达上调(P<0.05)。结论:AKR1C3可作为潜在分子标志物用于OSCC的早期诊断、治疗靶点的选择和预后评估。

• 单位
  河北医科大学第四医院