海南自贸港建设是党中央和国务院在改革开放的新时期作出的重要决策,自贸港党的基层组织建设的成败直接影响着党组织建设的形象和适应力水平。文章分析在海南自贸港建设背景下,高校党的基层组织建设的重要性,提出在自贸港建设环境下高校党的基层组织建设面临的新挑战。为积极应对这些挑战,应采取完善落实基层选举工作、强化组织服务功能、营造风清气正领导环境、强化组织领导软实力建设和增强组织领导适应力五个方面的对策。