不同基因型戊型肝炎病毒株宿主选择性差异的基因突变分析

作者：王晨; 付红伟; 杨桂芳

来源：实用检验医师杂志, 2018, 10(01): 1-4.

• 戊型肝炎病毒
• 宿主
• 核酸决定子

目的初步探讨影响不同基因型戊型肝炎病毒(HEV)能否跨物种传播的核苷酸或氨基酸突变位点的特点。方法从DNA序列Gen Bank数据库获得87株HEV全基因组序列,根据宿主选择不同的特点将其分为H类和Z类,其中H类为基因1型和2型,Z类为基因3型和4型。通过ALIGNX软件对两类中全部HEV全基因组序列进行比对分析,寻找影响两类HEV病毒株间宿主选择或致病性差异的可疑核苷酸或氨基酸突变位点。结果本研究共发现26个可疑的核苷酸或氨基酸突变位点,可能参与决定不同基因型HEV宿主选择性差异;这些突变位点分布在ORF1区有16个,ORF2区有7个,ORF3区有1个,5’UTR和3’UTR区分别各有1个,特别是G11A/C(5’UTR区)、T511S(E2s蛋白决定簇区)及E78D(ORF3区)相对于其他突变子更为重要。结论 26个可疑特异性核苷酸或氨基酸突变位点的发现为研究不同基因型HEV宿主选择性和致病性差异提供了重要线索。

• 单位
  天津医科大学总医院