基于生物信息学筛选胃癌失巢凋亡相关基因并构建预后模型

作者：徐腾腾; 杨长青; 魏子白^*; 纪爱芳; 麻丽霞; 赵婉彬; 张显花

来源：现代消化及介入诊疗, 2023, 28(05): 578-583.

• 胃癌
• 生物信息学
• 失巢凋亡
• 预后模型

目的 采用生物信息学方法探讨失巢凋亡相关基因(Anoikis-related genes, ANRGs)在胃癌中的预后价值，并建立了基于ANRGs的预后风险评分模型。方法 从GeneCards数据库和Harmonizome数据库获得515个ANRGs。首先从TCGA数据库获得胃癌患者的基因表达数据和临床资料，并利用R4.2.2软件提取出差异表达的ANRGs,其次采用单因素COX回归筛选出与总生存期(OS)有关的ANRGs,再次采用LASSO回归和多因素COX回归构建ANRGs的预后风险评分模型。根据风险评分，将胃癌患者区分为高风险组和低风险组。最后计算ROC曲线下面积(AUC)和绘制Kaplan-Meier(K-M)生存曲线评估模型的预测性能，并使用GSE84437数据集进行验证。进一步评估风险评分与肿瘤免疫微环境之间的关系。将风险评分与临床病理特征相结合，建立基于ANRGs的列线图来预测总生存期。结果 筛选178个差异表达的ANRGs, 51个基因与预后相关，并从中选择10个基因来构建预后风险评分模型。该模型中，高风险组的总生存期显著低于低风险组(P<0.001),训练集(AUCmax=0.723)和验证集(AUCmax=0.655)证明该模型对患者的预后显示出较好的预测性能。免疫功能分析表明，高风险组和低风险组具有不同的免疫状态。列线图结果表明，可以准确预测胃癌患者的生存率。结论 本研究建立了一个由10个ANRGs组成的胃癌预后模型，该模型可为胃癌患者的个体化用药提供重要参考。

• 单位
  长治医学院; 长治医学院附属和平医院; 中心实验室