低氧胁迫下唇?及杂交F1代肝脏转录组学分析

作者：陶丽竹; 陈健; 陈霞; 杨淞; 罗小波; 李思言; 杨壮志^*

来源：四川动物, 2023, 42(02): 161-171.

• 唇?
• 杂交?
• 低氧胁迫
• 转录组分析
• 差异表达基因分析

为探讨低氧胁迫对唇?Hemibarbus labeo和杂交?基因表达水平的影响，基于Illumina HiSeq高通量测序平台，对低氧条件下唇?和杂交?肝脏组织进行转录组测序并开展生物信息学分析。结果显示，唇?和杂交?分别产生了126 646 494个和130 613 321个clean reads，组装后共获得了48 027个unigenes，分别在NR、SwissProt、GO、COG、KOG、eggNOG4.5、KEGG数据库中获得32 253个注释；低氧胁迫时，分别有3 589个和3 177个差异表达基因（DEGs）上调，4 075个和5 473个下调；GO功能富集分析发现，DEGs与细胞结合、催化活性和代谢进程密切相关，KEGG通路富集分析发现，DEGs富集在一些与代谢和细胞生长增殖、分化、凋亡相关的信号通路中。研究结果为深入开展唇?和杂交?溶解氧胁迫的调控机制和养殖育种提供了参考。

• 单位
  成都市农林科学院; 四川农业大学