组织自主性是本科教学改革不可绕过的现实命题。目前我国本科教学改革组织自主性尚不成熟,具体表现为政府、市场、高校、基层院系组织与学人等关键性力量之间形成了一种单向运作机制,要突破这一困境,关键在于构建减少政府过度干预与寻求政府支持并遵循本科教学改革内在逻辑之间的平衡,由此,"合理自主性"成为其未来路向。