黄梁木实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择

作者：张登; 李景剑; 张梦洁; 包钰韬; 杨霄; 徐武云; 欧阳昆唏; 陈晓阳^*

来源：植物学报, 2018, 53(06): 829-839.

• 黄梁木
• 实时荧光定量PCR
• 内参基因

为筛选黄梁木(Neolamarckia cadamba)实时定量PCR最佳内参基因,该研究以黄梁木的根、芽、叶、花、果、皮及形成层为材料,利用RT-qPCR技术对ACT、CAC、CYP和EF1α等21个管家基因家族43个候选内参基因进行表达量分析,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper软件进行内参基因稳定性分析。geNorm的分析结果显示, UPL基因的稳定性最高(M=0.443),UBQ基因的稳定性最低(M=2.859);NormFinder的分析结果显示,UPL基因的稳定性最高(E=0.223),UBQ基因的稳定性最低(M=4.759);BestKeeper分析显示,UPL基因的标准偏差(SD=0.513)最低。研究结果表明,UPL基因作为内参基因稳定性最高, UBQ基因的稳定性最低。因此可以选择UPL基因作为黄梁木不同组织中RT-qPCR定量分析的内参基因。

• 单位
  华南农业大学; 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室