采用染色质免疫沉淀联合芯片技术分析胃癌全基因组蛋白H3K27三甲基化水平

作者：钟克力; 张丽; 戴勇; 周汉新; 王春友

来源：临床肿瘤学杂志, 2009, 14(01): 15-19.

• 组蛋白H3K27
• 三甲基化
• 芯片
• 染色质免疫沉淀
• 胃癌

目的:研究胃癌细胞全基因组蛋白H3K27的三甲基化水平。方法:收集我科2007年10月~2008年1月间8例胃癌患者的病灶组织和正常胃黏膜组织,采用染色质免疫沉淀联合芯片技术(ChIP-chip)在全基因组范围内对两种组织细胞的组蛋白H3K27进行高通量的检测。随后采用染色质免疫沉淀-实时定量聚合酶联反应(ChIP-qPCR)验证芯片结果,定量反转录聚合酶联反应(qRT-PCR)检测H3K27显著差异基因的mRNA表达水平。用统计软件进行基因筛选。结果:经两种组织细胞组蛋白H3K27三甲基化水平对比,筛选出234个基因存在H3K27显著差异,肿瘤细胞中有71个基因显示有H3K27三甲基化程度增高,161个基因H3K27甲基化程度降低;ChIP-qPCR验证结果与CpG岛芯片检测结果一致。结论:和正常胃黏膜组织细胞相比,胃癌细胞多个基因组蛋白H3K27三甲基化存在显著改变。ChIP-chip检测技术有利于进一步揭示胃癌发生的分子机制,发现新的基因治疗靶点。

• 单位
  华中科技大学同济医学院附属协和医院; 广东省深圳市人民医院