沙芥SSR反应体系建立及遗传多样性分析

作者：曹镇宇; 张晓艳; 庞杰; 秦鑫愿; 张凤兰^*; 杨忠仁; 郝丽珍

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 沙芥
• 斧翅沙芥
• DNA提取
• SSR-PCR反应体系
• 遗传多样性

为了探究适合中国特有沙生蔬菜——沙芥的DNA提取方法，建立SSR反应体系，分析其遗传多样性，以沙芥的叶片为材料，通过对不同提取方法的比较，探索出改良CTAB法为最适提取方法。同时，此方法也可应用于同属的斧翅沙芥的DNA提取。利用正交设计，建立沙芥SSR反应最佳体系为dNTPs、Mg2+和引物的最适浓度为0.2 mmol/L、1.5 mmol/L、0.2 μmol/L，Taq酶适宜加入量为0.2 U，模板DNA含量为30 ng；引物的最佳退火温度为56 ℃。利用优化体系对7个居群的沙芥样本进行扩增，结果表明：10对引物共扩增出位点40个，多态性位点为36个，多态性位点比率为90%。在沙芥7个居群中，多态性位点比率均值为50.00%；Nei’s基因多样性均值为0.156 6；香农信息指数均值为0.237 6。对比得出内蒙古自治区阿拉善居群的遗传多样性最大，内蒙古自治区乌审旗居群的遗传多样性水平最低。

• 单位
  园艺与植物保护学院; 内蒙古自治区农牧业科学院; 内蒙古农业大学