白菜中BrpR8长非编码RNA表达特性

作者:岑曦; 李丹丹; 刘自广; 刘春晓; 杨贺; 黄小庆; 李爽; 汤川泰; 吴娟*
来源:基因组学与应用生物学, 2019, 38(10): 4641-4646.
DOI:10.13417/j.gab.038.004641

摘要

为了研究白菜中BrpR8长非编码RNA的表达特性,本研究运用生物信息学、整体原位杂交及Northern blotting等方法,对BrpR8 lncRNA进行序列及二级结构特征、表达特性及应激应答特性分析。结果表明:BrpR8 lncRNA长度约261 nt,是白菜中发现的拟南芥AtR8 lncRNA (259 nt)的同源物,它具有RNA聚合酶Ⅲ转录物结构特征,在种子萌发阶段根伸长区特异表达,并响应CuCl2和SA应激环境。结果表明,BrpR8 lncRNA的发现扩大了长非编码RNA已有的物种,为非编码RNA的研究提供了数据参考。