中华猕猴桃bZIP家族成员的比较基因组学分析

作者：于丰源; 蒋礼玲^*; 贾举庆; 张真真; 陈思佳; 牛向丽; 王明雪; 黄胜雄^*

来源：应用与环境生物学报, 2020, 26(02): 226-235.

DOI：10.19675/j.cnki.1006-687x.2019.06032

• bZIP
• 中华猕猴桃
• 系统进化
• 比较基因组学分析
• 基因表达模式

bZIP转录因子调控着植物的生长发育和逆境胁迫应答,是植物中一类重要的转录因子.基于系统的生物信息学方法,鉴定得到79个中华猕猴桃bZIP转录因子,进化分析结果揭示中华猕猴桃bZIP家族成员在J、K、L三个分组中出现了成员的缺失.中华猕猴桃bZIP家族成员的bZIP保守域主要由碱性结构域和亮氨酸拉链结构域组成,其亮氨酸拉链结构域的第4、5肽段的第7位的亮氨酸残基存在一定程度的变异.bZIP保守域之外,在中华猕猴桃的18个bZIP家族成员中,还发现包括bZIPC保守域在内的8种其他类型的保守域,集中分布在A、C、D和G组bZIP成员中.通过与葡萄和番茄bZIP同源基因的比较,阐明中华猕猴桃基因组的两次三倍倍增是其bZIP基因数目增加的主要原因.中华猕猴桃不同发育时期果实的转录组揭示了参与调控果实成熟的57个bZIP基因的表达水平.本研究阐明了中华猕猴桃bZIP家族成员的进化特征、保守域组成、家族成员数目扩增的主要原因,提供了涉及果实发育的优良候选基因.(图6表2参28)

• 单位
  青海大学; 合肥工业大学; 食品与生物工程学院; 山西农业大学