我国小反刍兽疫病毒H基因序列分析

作者：李飞; 李岳洋; 张路瑶; 马海璐; 张保军; 蒋秀梅; 马世强; 赵丽; 刘永宏

来源：江苏农业科学, 2017, 45(07): 149-158.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2017.07.040

• 小反刍兽疫
• H基因
• 序列分析
• 核苷酸同源性
• 氨基酸同源性

为了分析我国小反刍兽疫疫情的特点,从GenBank下载我国和其他国家小反刍兽疫病毒(PPRV)毒株H基因全序列,应用分子生物学软件DNAStar进行序列分析。结果显示,始于2007年的我国首次PPR疫情中,我国西藏地区PPRV各毒株间H基因核苷酸同源性介于99.6%100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于86.7%98.3%之间;我国西藏地区PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.7%100.0%之间,我国西藏与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.3%98.4%之间。始于2013年年底的我国又一次PPR疫情中,我国PPRV毒株间核苷酸同源性介于99.7%99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株核苷酸同源性介于87.2%97.5%之间;我国PPRV毒株间氨基酸序列同源性介于99.2%99.8%之间,我国与其他国家PPRV毒株氨基酸序列同源性介于89.0%98.4%之间。H基因进化树分析结果显示,我国的9株PPRV划分为基因Ⅳ系。我国PPRV毒株与印度毒株及土耳其毒株同源性最高,可能由这2个国家传入我国。

• 单位
  塔里木大学; 新疆生产建设兵团; 动物科学学院