新疆和田地区2016年甲型肝炎病毒流行株基因特征

作者：何晓兰; 黄腾达; 艾德尔艾力·阿有甫^*; 杜凤雪; 周文亭; 曹经瑗^*; 毕胜利

来源：中国疫苗和免疫, 2020, 26(02): 142-145.

DOI：10.19914/j.cjvi.2020.02.004

• 甲型肝炎病毒
• 基因型
• 中和抗原位点
• 同源性
• 变异

目的了解新疆和田地区甲型肝炎病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法收集新疆和田地区2016年甲型肝炎病例急性期血清标本,经核酸提取、逆转录、套式PCR、序列测定,进行HAV基因分型、主要中和抗原位点氨基酸序列分析,并与GenBank中HAV基因型和亚型代表株构建系统进化树,分析核苷酸和氨基酸序列差异或同源性。结果获得和田地区43株2016年IA基因亚型HAV流行株和2株减毒活疫苗株序列。43株流行株在VP1-2A区的核苷酸、氨基酸序列差异分别为0.0%-2.9%、0.0%-1.9%,在VP3-VP1-2A区分别为0.0%-2.2%、0.0%-0.7%;与2株减毒活疫苗株的氨基酸序列差异为0.5%-0.9%。HAV流行株的主要中和抗原位点未发现氨基酸变异,处于负向选择压力;与GenBank中中国新疆、中国四川或日本HAV序列的同源性最高。结论 2016年和田地区HAV流行株为基因IA亚型且分为不同基因簇;HAV流行株和减毒活疫苗株的主要中和抗原位点氨基酸序列保守。

• 单位
  中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所