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摘要
真菌内生细菌是一类特殊细菌，在寄主真菌体内及生态系统中发挥重要作用。为发掘盘龙参内生真菌内具有促生功能的内生细菌资源，并探索其生物学功能，采用荧光原位杂交（fluorescence in situ hybridization, FISH）检测高粱附球菌Epicoccum sorghinum菌丝中内生细菌的存在后，利用菌丝组织研磨法分离内生细菌，通过菌落形态、生理生化特性及分子特征对其进行鉴定。运用特异性引物验证细菌的内生性，采用Salkowski比色法、CAS比色法以及钼锑抗比色法对菌株的促生特性进行测定，通过水稻种子促生长实验初步验证内生细菌的促生长能力，并对内生细菌进行全基因组测序和促生相关功能基因分析。真菌E.sorghinum菌丝内能观察到与荧光素标记的单链核酸探针杂交后的细菌，证实其菌丝内含有细菌，从菌丝内分离出一株内生栖稻根瘤菌Rhizobium oryzihabitans 7-2H，具有产吲哚乙酸（IAA）、铁载体和溶磷能力，可显著提高水稻幼苗的茎长、根长、鲜重和干重。菌株7-2H与标准菌株R. oryzihabitans M15基因组之间的平均核酸一致性（average nucleotide identity, ANI）值为96.98%，通过对基因组分析发现，菌株7-2H含有与产IAA、铁载体及溶磷能力相关的基因。分离得到一株真菌内生栖稻根瘤菌，该菌具有良好的促进植物生长特性，可作为后续研发微生物菌肥的菌种资源。
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