摘要
目的通过生物信息学方法,寻找糖尿病合并腹主动脉瘤(AAA)患者中差异表达的基因,明确其功能,探讨发病机制。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中下载人糖尿病GSE21321和人腹主动脉瘤GSE7084数据集,以P<0.05及表达变化>2.0倍标准筛选差异基因。联合运用Gencript数据库和predictprotein平台分析蛋白质亚细胞定位,并通过荧光共定位实验进行验证;STRING数据库分析缺氧诱导脂滴相关蛋白(HILPDA)的相互作用。采用SPSS 13.0软件进行数据分析,计量资料差异比较采用方差分析。结果筛选出HILPDA基因(在2型糖尿病中上调11.35倍,腹主动脉瘤中上调6.4倍);亚细胞定位结果预测HILPDA多分布于细胞核和线粒体中,荧光染色共定位分析证实了HILPDA在血管平滑肌细胞的细胞核和线粒体中有较高的表达;蛋白质互作网络分析证实HILPDA相关蛋白与细胞对缺氧的反应、脂质滴相关。与瘤旁动脉组织(对照组)比较,在糖尿病合并AAA患者组织中HILPDA蛋白的高表达更为显著[(47.2±5.6)%和(71.5±4.7)%,P<0.01)]。结论 HILPDA基因对糖尿病合并腹主动脉瘤的诊断和治疗的临床研究可能具有潜在的指导价值。
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单位华北理工大学; 唐山市人民医院; 公共卫生学院