烟草bZIP基因家族的鉴定及其在不同成熟度烟叶中的表达分析

作者:**翰; 张炳辉; 顾钢; 杨玄松; 秦明月; 谢小芳*
来源:中国烟草学报, 2021, 27(02): 53-64.
DOI:10.16472/j.chinatobacco.2020.174

摘要

通过生物信息学方法,从普通烟草中共鉴定了126个bZIP家族基因。基因结构分析表明:不同成员间外显子数目差异较大,最大达到13个,最少仅为1个。进化分析发现:126个NtbZIP基因被聚为11个亚族,同一亚族中的基因成员大多具有相似的外显子组成。bZIP 结构域分析表明:家族成员的核心结构域非常保守,各成员都具有碱性区和亮氨酸拉链区。烟草与拟南芥bZIP基因系统进化分析显示:11个亚族中均存在烟草和拟南芥的bZIP成员,其中S分支所含的家族成员最多,共有43个成员。NtbZIP基因表达分析发现:大部分NtbZIP基因在不同成熟度烟叶中都有表达,但是不同成员的表达模式存在差异,其中NtbZIP84,NtbZIP115,NtbZIP119和NtbZIP120等基因表达量随成熟度提高而逐渐降低。