RT-SHIV rt基因单拷贝PCR扩增方法的建立及初步应用

作者：鞠斌; 王卫; 丛喆; 姚南; 陈霆; 杜文达; 苏爱华; 高锡强; 魏强

来源：中国比较医学杂志, 2012, (10): 37-42.

DOI：10.3969/j.issn.1671-7856.2012.010.009

• RT-SHIV
• 单拷贝PCR
• rt基因 RT-SHIV
• Single genome amplification assay
• rt gene.

目的建立RT-SHIV病毒全长rt基因单拷贝PCR扩增方法,用于HIV-1 rt基因体内遗传与变异研究。方法 Oligo软件设计RT-SHIV rt基因特异性扩增引物,梯度稀释方法进行特异性和灵敏度筛选,进而优化退火温度和PCR反应最佳循环数等条件,建立rt基因PCR扩增方法;在此基础上将模板进行有限稀释,摸索rt基因单拷贝PCR扩增条件;使用该方法扩增感染猴体内RT-SHIV病毒rt基因,BioEdit软件进行基因序列分析。结果筛选得到一组巢式PCR引物,成功建立了RT-SHIV rt基因PCR扩增方法;当模板浓度为100 copies/μL时,扩增产物为单拷贝序列;测序结果显示RT-SHI...

• 单位
  国家中医药管理局; 中国医学科学院医学实验动物研究所