茶树(Camellia sinensis)分枝相关基因家族IGT的鉴定与表达分析

作者:尚小文; 秦昊; 段玉; 王婷; 雷小刚; 张琛; 曹语; 朱旭君; 房婉萍; 马媛春
来源:分子植物育种, 2022, 1-9.

摘要

本研究旨在对茶树中IGT基因家族进行鉴定,分析其系统发育过程、基因结构、保守结构域和表达模式。将拟南芥七个IGT蛋白序列和五个IGT保守结构域在茶树数据库TPIA进行ViroBLAST,利用多种生物信息学手段对其基因序列,启动子元件等进行分析,利用RT-qPCR分析了CsIGT成员在茶树不同组织中的表达模式。在茶树中共鉴定出四个CsIGT基因,包含IGT基因家族特异性结构域(G?L (A/T) IGT)且具有相似基因结构。除CsIGT-1外,CsIGT2-4具有相同的5个蛋白基序,这5个基序分别对应LAZY1亚家族中的5段特殊保守结构域。在四个CsIGTs基因启动子区域内广泛分布着光响应元件和水杨酸响应元件。系统发育表明CsIGT-2和CsIGT-4为LAZY1亚家族,在单子叶和双子叶植物中高度保守;CsIGT-1和CsIGT-3则属于DRO亚家族成员,与木本植物具有较高同源性。在舒茶早注释数据库中检索到CsIGT-3和CsIGT-4分别定位于染色体chr2和chr12。CsIGTs基因在不同组织中呈现不同的表达趋势,且在叶中高表达,这与其涉及调控茶树分枝角度的功能相一致。