贵州地区人类埃可病毒14型的VP1基因特征分析

作者:程金芝; 王宇*; 任刚; 苏飞; 唐小敏*
来源:中国病毒病杂志, 2022, 12(06): 422-427.
DOI:10.16505/j.2095-0136.2022.0073

摘要

目的 分析贵州地区人类埃可病毒14型(Echovirus 14,ECHO 14)分离株的VP1基因特征,为ECHO 14的防控提供科学依据。方法 收集2001—2021年贵州省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis, AFP)监测系统中从AFP病例及健康儿童粪便标本中分离到的15株ECHO 14毒株并进行回顾性鉴定分析,采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增出VP1基因并对扩增产物测序,用MEGA7.0构建系统进化树并对氨基酸位点突变进行分析。结果 贵州地区15株ECHO 14分离株属于A、B和C基因亚型,其中A基因亚型占比达80.0%(12/15)。15株ECHO 14分离株之间的核苷酸一致性为81.8%~97.1%,氨基酸同源性为94.3%~99.7%,与原型株Tow (Rhode Island/54)株之间的核苷酸一致性为77.1%~79.4%,氨基酸同源性为95.1%~98.4%;与ECHO 14原型株Tow株比较分析,结果显示在VP1氨基酸序列上存在33个突变位点,其中8个位点已完全突变分别为N8D、K132T、G157D、L217M、V237I、M295L、H296Q和H298R。结论 2000—2021年贵州省AFP病例中分离的ECHO 14毒株属于A、B和C基因亚型,VP1区的氨基酸多位点变异,可能导致了多条传播链在贵州地区共循环,其中A基因亚型是2006年后贵州地区传播的优势亚型。

  • 单位
    中心实验室; 基础医学院; 贵州省疾病预防控制中心; 贵州医科大学; 贵阳市第一人民医院